在正常情況下，人體的免疫系統是一種防禦機制，會針對外來侵入的敵人如細菌或病毒，產生抗體進行攻擊，可保護身體免於外界的侵襲。但在某些情況下，免疫系統失調無法分辨敵我時，會對自己正常的細胞產生自身抗體（Autoantibody），造成身體的傷害而罹患自體免疫疾病（Autoimmune disease）。

自體免疫疾病種類有數十種，有些只會侵犯特定的器官例如甲狀腺，臨床上常見的葛瑞夫茲氏病（Grave’s disease）、橋本氏甲狀腺炎（Hashimoto’s thyroiditis）都屬此類；有些則會造成全身性的病變，如全身性紅斑狼瘡（Systemic lupus erythematosus, SLE）、類風濕性關節炎（Rheumatoid arthritis, RA）等。對於引起自體免疫疾病的詳細原因至今仍不清楚，一般普遍認為與遺傳、環境因素有關，污染源增加、壓力以及生活型態的改變都可能是誘發的因子。根據健保署的統計，臺灣罹患自體免疫疾病的人數有年年成長的趨勢，已有10.5萬人因罹患需終身治療之全身性自體免疫症候群，而被健保認定為重大傷病。。

自體免疫疾病的症狀複雜且變化多端，即使是同一種疾病症狀也可能差異很大，加上每個病人的病情嚴重度不同，更造成診斷上的困難，因此常需藉由各種檢驗檢查來協助醫師及早診斷與治療。常見的自體免疫疾病血液檢驗如下，須由醫師根據症狀、相關病史、各項檢查檢驗結果做整體性的判斷。