社區肺炎（community - acquired pneumonia ; CAP）是指發生在住院或住院未超過48小時病人的一種急性肺臟感染，是常見且可嚴重威脅健康與性命的下呼吸道感染性疾病，在大於60歲以上的老年罹患者中CAP的死亡率約10-15％。

臨床上常見的致病原包括有細菌、病毒以及非典型病原體，會因人群、地區及季節而有所變化。近年來，在全球關於CAP的研究中，常見導致CAP的病原體包括肺炎鏈球菌（S. pneumoniae）、流感嗜血桿菌（H. influenza）和金黃色葡萄球菌（S. aureus）等細菌；病毒病原體則有呼吸道融合病毒副流感（respiratory syncytial virus）、A型及B型流感（influenza A and B）、副流感（parainfluenza）、腺病毒（adenovirus）、鼻病毒（rhinovirus）、人類間質肺炎病毒（human metapneumovirus）、巨細胞病毒（cytomegalovirus）等比例逐年降低；而非典型肺炎病原體肺炎黴漿菌（Mycoplasma pneumoniae）約占2-30％、肺炎披衣菌（Chlamydia pneumoniae）約占6-19％、嗜肺退伍軍人桿菌（Legionella pneumophila）約占2-15％，三者呈現逐年增加趨勢。非典型肺炎（atypical pneumonia）是指與典型肺炎有所不同的另一類下呼吸道感染性疾病，各年齡層人口群均可能感染，通常病情較輕，亦可自行痊癒，但在免疫功能不全的嬰幼兒和老年人中，則可能會衍生重症。

進行培養分離此三種造成非典型肺炎病原體為最可靠的檢查方法，但其生長十分緩慢、培養陽性率也不高，因此臨床上用途不大。血清學檢驗為目前實驗室主要的診斷工具，人體感染病原體後約7到10天，即可檢測出對其抗原產生IgM、IgA、IgG之抗體，在3到6週後達到高峰，而後逐漸降低，IgM抗體可持續存在數週到1年之久，在40歲以上通常是再次感染，可能不產生IgM抗體，僅產生IgG抗體，IgG抗體在急性感染後可持續存在長達數年。酵素免疫分析法（Enzyme Immunoassay；EIA）為血清學檢驗最常用的方法，其敏感性與特異性皆達95％以上，確定診斷需要急性期與恢復期同時測定IgG抗體效價有4倍以上的上升差異；當兩次IgG抗體結果為陽性，但無顯著上升時，判定為過去曾經感染；單一次檢測IgM或IgG抗體的結果，不能當作是否急性感染的確定診斷，尤其是成人。

肺炎黴漿菌和肺炎披衣菌可使用鼻咽拭子，進行聚合酶連鎖反應（polymerase chain reaction；PCR）檢測病原體DNA，在診斷上有極高的敏感性與特異性，其優點在於可以迅速早期的診斷急性感染，缺點是實驗成本較高，且需要花費較多的心力對於探針及引子的效能進行確認，因此目前沒有被廣泛應用。

退伍軍人桿菌以EIA和PCR等方法均有助於其確診，目前實驗室常使用免疫色層分析法（immunochromatographic test）測定尿抗原，可在短時間內測得結果，提供一般醫院及第一線現場直接檢測，對即時提供患者治療及後續防疫決策之參考有極大的幫助。

診斷治療非典型肺炎，最重要的是從臨床症狀、病史、實驗室檢驗與X光表現中，對高度懷疑感染的病人，及早給予治療，因為除了PCR檢測可以早期確定急性感染外，沒有任何一項實驗室檢驗可以快速百分百準確診斷其感染，而且在試劑廠牌間敏感性及特異性差異很大，故在解釋報告時需注意。