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專題報導

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癌症基因檢測奧秘~次世代定序檢測在癌症治療的角色
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病理部醫事檢驗師 洪子淳

 

「癌症」即惡性腫瘤,已經蟬聯臺灣10大死因之首超過40年了,平均每10分鐘就有一人癌逝。值得安慰的是,面對這個人人聞之色變的對手,已有越來越多的癌症能找到相對應的藥物來對抗癌細胞的基因突變。當越瞭解對手,我們就更能對症下藥,也就是我們目前耳熟能詳的精準治療或是標靶治療。


基因檢測的重要性是什麼?

當一個或多個與癌症相關的基因發生不正常突變時,便可能會使細胞不正常增殖,產生癌症。基因突變可能是遺傳來的,也可能是後天才產生的。針對有癌症家族史,基因檢測可釐清是否帶有家族遺傳性癌症基因變異,若有攜帶基因變異,容易引起早發型或多發性癌症,可及早進行癌症預防措施和家族遺傳諮詢,提高存活率與生活品質。

此外,基因檢測也可以提供醫師治療的方向,就像輸血前要知道血型,而治療前要了解自己的癌症帶有什麼基因突變,更能對症下藥。

當身體有癌細胞出現時,腫瘤細胞死亡或代謝釋放到血液中的游離DNA片段則稱為腫瘤游離DNA(circulating tumor DNA, ctDNA),我們也能藉由抽血監控腫瘤變化及治療的後續追蹤,協助醫師評估是否需要額外的臨床治療。


什麼是次世代定序?

次世代定序又稱為大量平行定序,原理就是將DNA切成小片段後,同時進行大量的短片段擴增及定序,最後再由電腦運算將龐大的資料拼湊成報告。一個人大約有2.1 萬個基因,其中約400個基因與癌症高度相關。而次世代定序則像是撒大網,能一次分析大量基因、且速度快、敏感性與專一性高,為醫師提供更完整的報告以及用藥處方方向,因此成為現階段癌症基因檢驗的趨勢。


如何選擇傳統基因檢驗或是使用次世代定序?

首先要了解癌症種類,須檢測多少基因、哪些基因。由於每種癌症容易發生的基因突變不同,且單基因檢驗費用較便宜,所以有時單基因檢測已足夠。如早期肺腺癌約50~60%有EGFR基因突變,而其他ALK、ROS 1及BRAF所占比率都小於5%,所以會建議先從EGFR檢測做起。若為Wild type(野生型)再考慮更進一步的次世代定序檢測。

通常醫師會建議使用次世代定序進行多基因檢測,其原因歸納如下:

  1. 治療成效不彰
    若為反覆復發、治療後產生抗藥性、或目前治療效果不彰的病友,就會建議使用次世代定序去找尋是否有較罕見的基因突變,尋找其他可行的治療方針。
  2. 生命與時間賽跑
    在有限的時間內,若能快速的找到可以藥物治療的基因突變,病友能更快接受精準的用藥,提升存活的機率。或是排除不適合的用藥,避免承受不必要的副作用和醫藥支出。
  3. 免疫治療評估
    免疫治療就是要喚醒體內的軍隊來對抗癌細胞,常見的檢測項目有
    a. PD-1、PD-L1表現量
    b. 微衛星不穩定性MSI檢測
    c. 免疫調節基因
    d. 腫瘤突變負荷(tumor mutational burden, TMB): 計算腫瘤細胞中帶有多少突變基因(somatic protein-coding base substitutions and insertion/deletion mutations),若TMB越高,則可能產生越多的腫瘤新生抗原(tumor neoantigen),而引起較強的免疫反應。
    過去的研究發現若非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)或黑色素瘤(melanoma),有高度的TMB(TMB≥10 Muts/Mb)對於免疫治療的效果較佳。
  4. 檢體量有限
    若檢體採集不易則須更珍惜使用,此時則須選用可同時檢測多種基因的檢驗方法。
    檢體種類可分為由病理部負責的固態腫瘤組織(Solid tumor)或是由檢醫部負責的液態切片(Liquid Biopsy),雖然不同廠牌的檢測會有所差異,但檢驗極限(Detection limit)幾乎都能達到5%。
  5. 罕見癌種
    若出現其他癌種常見的基因突變,可嘗試使用該藥物進行治療。

臺大醫院與健保在次世代定序扮演什麼角色

健保自2024年5月1日起為19大類癌症提供三種NGS定額給付方案,各癌別終生給付一次,以減少病友的負擔(詳見衛福部健保署官方網站)。臺大醫院不僅已建立各項NGS健保醫令、亦已符合給付醫院之資格且順利提出醫療費用申報、並成立分子腫瘤委員會(Molecular tumor board),為癌友提供更優質而完善的服務。

針對不同癌別健保有列出給付條件。如非小細胞肺癌應先執行EGFR為陰性才能申報,針對此類情況,本院也提供先自費檢測再依檢驗結果符合哪些給付進行退費,為病友爭取即早獲得治療及健保費用申報的權利。另外也積極參與健保相關會議,提供臨床需求之建議以及透過不斷評選及協商,篩選出優質且價格合理的廠商,希望能提供病友友善的醫療環境及精準的報告。



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